南京工業大學電氣工程與控制科學學院前身源于南京化工學院1958年成立的化工機械系，1977年開始招生化工自動化及儀表專業，1994年成立自動化與計算機系，后經兩校合并組建自動化學院，2008年12月更名為自動化與電氣工程學院，2015年4月更名為電氣工程與控制科學學院。學院是中國人工智能學會智能檢測與運動控制專委會、中國電工技術學會電氣工程教育專業委員會、江蘇省全國計算機等級考試技術服務中心掛靠單位。

學院以科產學研為特色，不斷拓展國內外合作。先后與法國勃艮第大學、澳大利亞昆士蘭大學、西班牙薩拉戈薩大學、英國斯旺西大學等知名高校開展研究生、本科生合作培養項目，與意大利國家計量研究院等國際知名院所簽訂戰略合作協議；同時，面向中科院醫工所、中科院長光所（滁州）、國電南瑞、浙江中控、上海德衡等國內大院名企，在人才培養、科學研究、社會服務等方面開展全方位產教融合合作。